一、基本概况：

陈红菊，女，中国科学院大学博士。主持云南省自然科学基金项目1项；云南省教育厅项目2项；中国科学院遗传资源与进化国家重点实验室项目2项；公开发表论文10余篇。

研究方向：（1）肠道菌群与疾病状态评估模型的建立与统计学分析

         （2）人类微生物菌群医学生态学理论和方法研究

二、科研论文发表情况

[1] Chen HJ, Yi B, Ma ZS. (2025). Resilience of human gut microbiomes in autism spectrum disorder: measured using stiffness network analysis. Microbiology Spectrum, 13: e01078-24.

[2] Chen HJ, Li Lianwei, Yu Fubing, Ma ZS. (2024). A comprehensive diversity analysis on the gut microbiomes of ASD patients: form alpha, beta to gamma diversities. Fems Microbiology Letters, fnae014

[3] Ma ZS, Li Lianwei, Chen HJ. (2024). Unique and enriched microbes and their potential “allies and foes” in the human gut microbiomes of ASD patients. Research in Autism Spectrum Disorders, 117, 102440

[4] Chen HJ, Ma ZS. (2022). Further Quantifying the Niche-Neutral Continuum of Human Digestive Tract Microbiomes with Near Neutral Model and Stochasticity Analysis. Evolutionary Bioinformatics online, 18, 11769343221128540.

[5] Chen HJ, Yi B, Qiao Y et al. (2022). Diversity-scaling analysis of human breast milk microbiomes from population perspective. Frontiers in Microbiology, 13, 940412.

[6] Chen HJ, Ma ZS. (2022). Niche-Neutral Continuum Seems to Explain the Global Niche Differentiation and Local Drift of the Human Digestive Tract Microbiome. Frontiers in Microbiology, 13, 912240.

[7] Yi B, Chen HJ. (2022). Power law analysis of the human milk microbiome. Archives of Microbiology, 204(9), 585.

[8] Zhou J, Yuan Y, Xu P, Yi B, Chen HJ*, Su, W. (2022). Host-Population Microbial Diversity Scaling of Chinese Gut Microbiomes in Gout Patients. Evolutionary Bioinformatics online, 18, 11769343221095858.

[9] Chen HJ, Yi B, Liu Q, Xu X., Dai, L., Ma ZS. (2021). Diversity Scaling of Human Digestive Tract (DT) Microbiomes: The Intra-DT and Inter-individual Patterns. Frontiers in Genetics, 12, 724661.

[10] Chen HJ, Peng S, Dai L, Zou Q, Yi B, Yang X, Ma, ZS. (2017). Oral microbial community assembly under the influence of periodontitis. PloS One, 12(8), e0182259.

三、主持和参与科研项目

[1]云南省教育厅项目，2023J1110, Covid-19患者的肠道微生物DAR模型研究, 2022.12-2023.12, 2万元，已结题，主持

[2]云南省科技厅青年项目，202001BA070001-100, 网络分析和博弈理论在宏基因组生物信息学研究中的应用, 2019.6-2022.6, 5万元，已结题，主持

[3]云南省教育厅项目，2019J0646, 基于DAR模型研究弥勒温泉微生物群落的生物多样性, 2019.12-2020.12, 2万元，已结题，主持

[4]中国科学院遗传资源与进化国家重点实验室开放课题，GREKF19-07, 肠道菌群多样性与疾病关系的生态机制研究, 2019.6-2022.5, 9万元，已结题，主持

[5]中国科学院遗传资源与进化国家重点实验室开放课题，GREKF13-03, 微生物群落的生态位-中性混合效应研究, 2013.6-2015.5, 13万元，已结题，主持

[6]国家自然科学基金面上项目, 31970116，菌群多样性与疾病关系的生态机制及病因研究, 2020.01-2023.12, 32万元，已结题，参与

[7]云南省科技厅青年项目, 202101BA070001-018, 微生物菌群的复杂网络可控性研究 2021.1-2024.11, 5 万元，已结题, 参与

[8]云南省教育厅项目, XJ4Y06, 关于“ICM+3IM”猜想的研究, 2017.1-2019.1, 2万元，已结题，参与

[9]云南省重大科技专项计划项目, 202402AA310017, 多阶段筛选胃内益生菌治疗幽门螺杆菌及其抗药性应对策略技术研发, 2024.1-2026.12, 600万元，在研，参与

四、获得主要学科竞赛奖励与荣誉

[1] 2017年荣获第三届全国高校数学微课程教学设计竞赛西南赛区一等奖

[2] 指导全国大学生数学建模竞赛荣获云南省三等奖，2020年，中国工业与应用数学学会

[3] 指导第十二届全国大学生市场调查与分析大赛云南省二等奖，2021年，教育部高校统计教指委

[4] 指导国家级大创项目，第三代基因测序组装策略优化及在生物医药的应用，2021年创业实践项目，结题为优秀

五、主持教学改革与质量工程项目

[1]本科教学建设与教学改革项目，《高等数学》教学改革探析，JJJG171021，2020年，校级.

六、教改论文发表情况

[1]陈红菊,易斌. 一类带有取整符号的级数的收敛性[J].高等数学研究,2025.